RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 AP1M1Q9BXS5 423 aa6.21□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC29A3Q9BZD2 475 aa6.21□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 TWSG1Q9GZX9 223 aa6.21□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 XKR8Q9H6D3 395 aa6.21□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 SLAMF7Q9NQ25 335 aa6.21□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.21□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 C1GALT1Q9NS00 363 aa6.21□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 FGF21Q9NSA1 209 aa6.21□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 SOHLH2Q9NX45 425 aa6.21□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 SYBUQ9NX95 663 aa6.21□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 GNPTGQ9UJJ9 305 aa6.21□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 SNX12Q9UMY4 172 aa6.21□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 SOX13Q9UN79 622 aa6.21□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 PIPSLA2A3N6 862 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 ARGFXA6NJG6 315 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 IQCF5A8MTL0 148 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 C19orf84I3L1E1 186 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 KPNA5O15131 536 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 PFDN6O15212 129 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 KDM1AO60341 852 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 PHF2O75151 1096 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 AVILO75366 819 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 GPC4O75487 556 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 NDUFS3O75489 264 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 TMEM63AO94886 807 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 VAPBO95292 243 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 RPN2P04844 631 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 APOA4P06727 396 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 CCNYL3P0C7X3 344 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 MSL3P1P0C860 447 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 MLNP12872 115 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 ST6GAL1P15907 406 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 PAMP19021 973 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 ITGA3P26006 1051 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 AOAHP28039 575 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 FNTAP49354 379 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 TERF1P54274 439 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 HSPA14Q0VDF9 509 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 IL10RAQ13651 578 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 TMED2Q15363 201 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 GPR19Q15760 415 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM69BQ5VUD6 431 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 ANKRD22Q5VYY1 191 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 MRNIPQ6NTE8 343 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 SPESP1Q6UW49 350 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 CES3Q6UWW8 571 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 CDH24Q86UP0 819 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 HOOK3Q86VS8 718 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 LRRC6Q86X45 466 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 PRIMA1Q86XR5 153 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 TMEM126BQ8IUX1 230 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 VRK3Q8IV63 474 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 KRT222Q8N1A0 295 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 OTUD6BQ8N6M0 293 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 MCUQ8NE86 351 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 FDCSPQ8NFU4 85 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 GRK7Q8WTQ7 553 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 ASZ1Q8WWH4 475 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 CPT1BQ92523 772 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 PNPLA2Q96AD5 504 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 MFSD3Q96ES6 412 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 PDLIM2Q96JY6 352 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 PANX3Q96QZ0 392 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 NRTNQ99748 197 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 PITPNM3Q9BZ71 974 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 P2RY12Q9H244 342 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 FANCEQ9HB96 536 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 SYTL2Q9HCH5 934 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 LHX9Q9NQ69 397 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 KCND1Q9NSA2 647 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 ACTR10Q9NZ32 417 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 OR6C2Q9NZP2 312 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 SAMD15Q9P1V8 674 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 PADI1Q9ULC6 663 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 ICKQ9UPZ9 632 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 CDYLQ9Y232 598 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 OSGIN2Q9Y236 505 aa6.2□□□□□ -1.42
CTDSPL-208ENST00000486978 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms