RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407997.3

APOBEC3G-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3G, Length 1,834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-201ENST00000407997 ATE1O95260 518 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 CPNE6O95741 557 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 SYPP08247 313 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 GSTT2P0CG29 244 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 GSTT2BP0CG30 244 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 PCSK2P16519 638 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 GABRG2P18507 467 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 JAK1P23458 1154 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 DGKAP23743 735 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 STK19P49842 368 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 TAS2R39P59534 338 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 IL2P60568 153 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 PSME3P61289 254 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 MPP1Q00013 466 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 NFATC2Q13469 925 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 NRF1Q16656 503 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 UAP1L1Q3KQV9 507 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 ANKDD1AQ495B1 522 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 SPATS1Q496A3 300 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 CDKL4Q5MAI5 379 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 NANOGP8Q6NSW7 305 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZYG11AQ6WRX3 759 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 Q6ZVU0 165 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 ARMCX6Q7L4S7 300 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 SFTPA1Q8IWL2 248 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 TRAM1L1Q8N609 369 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 STARD8Q92502 1023 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 LPGAT1Q92604 370 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 ATP6V1E2Q96A05 226 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZUFSPQ96AP4 578 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 UBXN10Q96LJ8 280 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 COPS8Q99627 209 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 MROQ9BYG7 248 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 OXSMQ9NWU1 459 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 PATE3B3GLJ2 98 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 CFLARO15519 480 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 NPHS1O60500 1241 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 NDUFS2O75306 463 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 LEFTY1O75610 366 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 TRIM16O95361 564 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 PIGNO95427 931 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRAMEF1O95521 474 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 CFIP05156 583 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLC35E2BP0CK96 405 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 GNSP15586 552 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 ENGP17813 658 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 ACRV1P26436 265 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 GABRB3P28472 473 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 SPINT3P49223 89 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 ARSDP51689 593 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 MESP2Q0VG99 397 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 ENPP2Q13822 863 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 IHHQ14623 411 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 NR1D2Q14995 579 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 CDKN3Q16667 212 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 PTPRNQ16849 979 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 ARSIQ5FYB1 569 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 WDR45BQ5MNZ6 344 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 CNSTQ6PJW8 725 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 CRTC1Q6UUV9 634 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 ISLR2Q6UXK2 745 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 MACC1Q6ZN28 852 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 LRTOMTQ8WZ04 291 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 MAGED4Q96JG8 741 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 VPS35Q96QK1 796 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 HGH1Q9BTY7 390 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 C9orf16Q9BUW7 83 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 TMEM245Q9H330 911 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 FAM83DQ9H4H8 585 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 FKBPLQ9UIM3 349 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 CDC14AQ9UNH5 594 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 ANKRD36A6QL64 1941 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 A0A1W2PQF6 199 aa9.72□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 AQP12BA6NM10 295 aa9.72□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 C16orf96A6NNT2 1141 aa9.72□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 AQP9O43315 295 aa9.72□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 GRID2O43424 1007 aa9.72□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 TSPAN6O43657 245 aa9.72□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 BNIP3LO60238 219 aa9.72□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 FCGR1AP12314 374 aa9.72□□□□□ -0.85
APOBEC3G-201ENST00000407997 CCNA2P20248 432 aa9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms