RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)M

tW(CCA)M, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)M, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)MtW(CCA)M CRD1Q07560 283 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M CLF1Q12309 687 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M RLF2Q12495 606 aa3.01□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M RAD50P12753 1312 aa3□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M SNA3P14359 133 aa3□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M TPM1P17536 199 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M TIM23P32897 222 aa3□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M SIS2P36024 562 aa3□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M UBP11P36026 717 aa3□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M ISW1P38144 1129 aa3□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M PAN5P38787 379 aa3□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M FAF1P40546 346 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M TPO2P53283 614 aa3□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M DIP5P53388 608 aa3□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M ORC4P54791 529 aa3□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M PNG1Q02890 363 aa3□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M AIM33Q04516 312 aa3□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M TAO3P40468 2376 aa2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M PRC1P00729 532 aa2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M ILV1P00927 576 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M SPT2P06843 333 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M SUP45P12385 437 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M RNR3P21672 869 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M UBC1P21734 215 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M ESS1P22696 170 aa2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M KIN82P25341 720 aa2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M SEC20P28791 383 aa2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M BRL1P38770 471 aa2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M YEL025CP39991 1188 aa2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M HMF1P40037 129 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M PCI8P40512 444 aa2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M ULP2P40537 1034 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M SPO74P45819 413 aa2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M INP52P50942 1183 aa2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M GCR2Q01722 534 aa2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M MUK1Q02866 612 aa2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M CSM3Q04659 317 aa2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M MAG2Q06436 670 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M WHI4Q07655 649 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M TFC8Q12308 588 aa2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M YPR117WQ06116 2489 aa2.99□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M IDI1P15496 288 aa2.98□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M VPS1P21576 704 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M AFT1P22149 690 aa2.98□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M SWI4P25302 1093 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M FUB1P25659 250 aa2.98□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M URK1P27515 501 aa2.98□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M CLB5P30283 435 aa2.98□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M MSS51P32335 436 aa2.98□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M SMY2P32909 740 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M RDH54P38086 958 aa2.98□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M RXT2P38255 430 aa2.98□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M RPN10P38886 268 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M CCT3P39077 534 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M VID30P53076 958 aa2.98□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M ZPR1P53303 486 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M DSE4P53753 1117 aa2.98□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M BNI5P53890 448 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M TRS120Q04183 1289 aa2.98□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M HSP82P02829 709 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M DED1P06634 604 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M CDC6P09119 513 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M CLN3P13365 580 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M MAK11P20484 414 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M GSY1P23337 708 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M ADK2P26364 225 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M SUV3P32580 737 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M FBP26P32604 452 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M PEX2P32800 271 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M ATG19P35193 415 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M POA1P38218 177 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M EAF5P39995 279 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M OPT1P40897 799 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M CIT3P43635 486 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M GCV2P49095 1034 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M MDR1P53258 950 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M HEH2Q03281 663 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M SPO71Q03868 1245 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M LCD1Q04377 747 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M EIS1Q05050 843 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M NOC3Q07896 663 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M DAP1Q12091 152 aa2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M TSR3Q12094 313 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
tW(CCA)MtW(CCA)M PGK1P00560 416 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M TUF1P02992 437 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M ADE4P04046 510 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data2.96□□□□□ -1.94not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M CSE2P33308 149 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M PGM1P33401 570 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M SAS3P34218 831 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M BMH2P34730 273 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M GCS1P35197 352 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M MNR2P35724 969 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M APN2P38207 520 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M PCM1P38628 557 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M GAA1P39012 614 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M RPN3P40016 523 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M AIM9P40053 627 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M ATG32P40458 529 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)MtW(CCA)M GPD2P41911 440 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 60.7 ms