RNA–Protein interactions for RNA: YMR287C

DSS1, Transcript of 3'-5' exoribonuclease, yeast

Gene DSS1, Length 2,910 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSS1	YMR287C	SPO20	Q04359	397 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DSS1	YMR287C	SPO75	Q07798	868 aa		5.06	□□□□□ -1.6
DSS1	YMR287C	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
DSS1	YMR287C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
DSS1	YMR287C	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
DSS1	YMR287C	RAD27	P26793	382 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DSS1	YMR287C	CCC2	P38995	1004 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DSS1	YMR287C	CEM1	P39525	442 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DSS1	YMR287C	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
DSS1	YMR287C	ELG1	Q12050	791 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DSS1	YMR287C	YOR131C	Q12486	218 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DSS1	YMR287C	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
DSS1	YMR287C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
DSS1	YMR287C	GPG1	P53130	126 aa		5.05	□□□□□ -1.6
DSS1	YMR287C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
DSS1	YMR287C	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
DSS1	YMR287C	YKL107W	P34251	309 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DSS1	YMR287C	MDJ1	P35191	511 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DSS1	YMR287C	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
DSS1	YMR287C	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
DSS1	YMR287C	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
DSS1	YMR287C	SLA2	P33338	968 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DSS1	YMR287C	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
DSS1	YMR287C	GDH3	P39708	457 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DSS1	YMR287C	YFL066C	P43538	392 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DSS1	YMR287C	HPF1	Q05164	967 aa		5.04	□□□□□ -1.6
DSS1	YMR287C	SNF5	P18480	905 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DSS1	YMR287C	NPP2	P39997	493 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DSS1	YMR287C	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
DSS1	YMR287C	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
DSS1	YMR287C	NPP1	P25353	742 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DSS1	YMR287C	PAF1	P38351	445 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DSS1	YMR287C	YAR028W	P39548	234 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DSS1	YMR287C	ALT1	P52893	592 aa		5.03	□□□□□ -1.6
DSS1	YMR287C	ERT1	P38140	529 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	ALR2	P43553	858 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	HNT2	P49775	206 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	YKE2	P52553	114 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	UGO1	Q03327	502 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	PTC5	Q12511	572 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	KIP1	P28742	1111 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	MXR1	P40029	184 aa		5.02	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	UGA2	P38067	497 aa		5.01	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	EAR1	Q03212	550 aa		5.01	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	OSH2	Q12451	1283 aa		5.01	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	GAL11	P19659	1081 aa		5	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	PET10	P36139	283 aa		5	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	YGL081W	P53156	320 aa		5	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	SAM35	P14693	329 aa		5	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	THI4	P32318	326 aa		5	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	VPS53	P47061	822 aa		5	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	TSR4	P25040	408 aa		5	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	ARE1	P25628	610 aa		5	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	HRQ1	Q05549	1077 aa		5	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	ATG13	Q06628	738 aa		5	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	YPL260W	Q08977	551 aa		5	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	ALG14	P38242	237 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	DSE4	P53753	1117 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	NHA1	Q99271	985 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	YNR063W	P53749	607 aa		4.99	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	MGS1	P40151	587 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	BUD9	P53226	547 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	YOR223W	Q12015	292 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	DPH6	Q12429	685 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	SAC7	P17121	654 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	MIH1	P23748	554 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	MCM7	P38132	845 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	GYP8	P43570	497 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	TOM20	P35180	183 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	HUL4	P40985	892 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	YJL045W	P47052	634 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	HXT16	P47185	567 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	GAS5	Q08193	484 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	PCL2	P25693	308 aa		4.96	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	YBR284W	P38150	797 aa		4.96	□□□□□ -1.61
DSS1	YMR287C	AI3	P03877	415 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	SPC29	P33419	253 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	MTC2	P34246	357 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	GPB2	P39717	880 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
DSS1	YMR287C	GPT2	P36148	743 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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