RNA–Protein interactions for RNA: YHR066W

SSF1, Transcript of Constituent of 66S pre-ribosomal particles, yeast

Gene SSF1, Length 1,362 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSF1	YHR066W	CNN1	P43618	361 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	GDE1	Q02979	1223 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	DFG16	Q99234	619 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	SAM35	P14693	329 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	MLS1	P30952	554 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	LYP1	P32487	611 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	MPH1	P40562	993 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	YSC84	P32793	468 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	RGD1	P38339	666 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	GIP4	P39732	760 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	TYW3	P53177	273 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	TRE1	Q08919	783 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	SPO21	Q12411	609 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	YER152C	P10356	443 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.24	□□□□□ -1.73	not detected
SSF1	YHR066W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	YHL012W	P38709	493 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	VAC8	P39968	578 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	CWC24	P53769	259 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	SSY1	Q03770	852 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	ESC2	Q06340	456 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	YPL260W	Q08977	551 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	YPL066W	Q12194	479 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	INO1	P11986	533 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	MCM7	P38132	845 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	YFL054C	P43549	646 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	SNF5	P18480	905 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	PRO1	P32264	428 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	YKL069W	P36088	180 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	BAP2	P38084	609 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	PTC7	P38797	343 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	GTS1	P40956	396 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	HNT2	P49775	206 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	CDA2	Q06703	312 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	NSI1	Q12457	570 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SSF1	YHR066W	PRI2	P20457	528 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	BAS1	P22035	811 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	MDL2	P33311	773 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	TNA1	P53322	534 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	OPI10	Q08202	246 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	ADP1	P25371	1049 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	YGL176C	P46945	554 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	SPO20	Q04359	397 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	GNT1	Q12096	491 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	COQ4	O13525	335 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	HSP78	P33416	811 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	THI80	P35202	319 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	MXR1	P40029	184 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	RSC58	Q07979	502 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	RKM4	Q12504	494 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	AGP1	P25376	633 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	YKL107W	P34251	309 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	PNT1	P38969	423 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	PIK1	P39104	1066 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	ORC3	P54790	616 aa		4.18	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	AIM26	P32858	118 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	CCZ1	P38273	704 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	VBA5	P36172	582 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.16	□□□□□ -1.74	RIP-Chip
SSF1	YHR066W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	SLA2	P33338	968 aa		4.15	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.15	□□□□□ -1.74	not detected
SSF1	YHR066W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	TAT2	P38967	592 aa		4.15	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	MBP1	P39678	833 aa		4.15	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
SSF1	YHR066W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SSF1	YHR066W	STE5	P32917	917 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SSF1	YHR066W	UGA2	P38067	497 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SSF1	YHR066W	FLR1	P38124	548 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SSF1	YHR066W	SHE9	Q04172	456 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SSF1	YHR066W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SSF1	YHR066W	RSB1	Q08417	382 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SSF1	YHR066W	ACM1	Q08981	209 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SSF1	YHR066W	YDL177C	Q12257	170 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SSF1	YHR066W	SPS1	P08458	490 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SSF1	YHR066W	GEM1	P39722	662 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SSF1	YHR066W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75

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