RNA–Protein interactions for RNA: YGL239C

YGL239C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YGL239C, Length 315 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YGL239C	YGL239C	RGD1	P38339	666 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	IRC24	P40580	263 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	TNA1	P53322	534 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	EEB1	Q02891	456 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	GDE1	Q02979	1223 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.27	□□□□□ -1.89	not detected
YGL239C	YGL239C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	SVF1	Q05515	481 aa		3.27	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	3.27	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	YER152C	P10356	443 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	LYP1	P32487	611 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	LRG1	P35688	1017 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	CCZ1	P38273	704 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	MET10	P39692	1035 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	MPH1	P40562	993 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	YFL054C	P43549	646 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	AVT1	P47082	602 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	TYW3	P53177	273 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	RSC58	Q07979	502 aa		3.26	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	INO1	P11986	533 aa		3.25	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	HNT2	P49775	206 aa		3.25	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	VPS16	Q03308	798 aa		3.25	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	RSB1	Q08417	382 aa		3.25	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	PIN2	Q12057	282 aa		3.25	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	DFG16	Q99234	619 aa		3.25	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	BAS1	P22035	811 aa		3.24	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	SEG2	P34250	1132 aa		3.24	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	VAC8	P39968	578 aa		3.24	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	MXR1	P40029	184 aa		3.24	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	YGR053C	P53234	283 aa		3.24	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	SPO20	Q04359	397 aa		3.24	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	ESC2	Q06340	456 aa		3.24	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	SPS1	P08458	490 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	SNF5	P18480	905 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	PRI2	P20457	528 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	3.23	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	BAP2	P38084	609 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	PIK1	P39104	1066 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	YGL176C	P46945	554 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	ECL1	P48235	211 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	ORC3	P54790	616 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	3.23	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	GNT1	Q12096	491 aa		3.23	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	YKL107W	P34251	309 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	YPL066W	Q12194	479 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	RKM4	Q12504	494 aa		3.22	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
YGL239C	YGL239C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
YGL239C	YGL239C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
YGL239C	YGL239C	UGA2	P38067	497 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YGL239C	YGL239C	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
YGL239C	YGL239C	OPI10	Q08202	246 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YGL239C	YGL239C	YDL177C	Q12257	170 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YGL239C	YGL239C	RNQ1	P25367	405 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YGL239C	YGL239C	RFC5	P38251	354 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YGL239C	YGL239C	MRPL22	P53881	309 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YGL239C	YGL239C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.2	□□□□□ -1.9	not detected
YGL239C	YGL239C	ACM1	Q08981	209 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YGL239C	YGL239C	SVS1	Q12254	260 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YGL239C	YGL239C	YKL069W	P36088	180 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YGL239C	YGL239C	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YGL239C	YGL239C	PNT1	P38969	423 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YGL239C	YGL239C	MBP1	P39678	833 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YGL239C	YGL239C	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YGL239C	YGL239C	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YGL239C	YGL239C	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YGL239C	YGL239C	PRP43	P53131	767 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YGL239C	YGL239C	YOR352W	Q08816	343 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YGL239C	YGL239C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YGL239C	YGL239C	BI4	P03879	638 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YGL239C	YGL239C	AGP1	P25376	633 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YGL239C	YGL239C	APL1	P27351	700 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YGL239C	YGL239C	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YGL239C	YGL239C	ELM1	P32801	640 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YGL239C	YGL239C	SLA2	P33338	968 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YGL239C	YGL239C	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.18	□□□□□ -1.9	not detected
YGL239C	YGL239C	GEM1	P39722	662 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YGL239C	YGL239C	SNO2	P53823	222 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YGL239C	YGL239C	RSM24	Q03976	319 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YGL239C	YGL239C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YGL239C	YGL239C	CMP2	P14747	604 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YGL239C	YGL239C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YGL239C	YGL239C	VBA5	P36172	582 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YGL239C	YGL239C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YGL239C	YGL239C	ENV11	P53246	860 aa		3.17	□□□□□ -1.9

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