RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552346.1

USP15-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-218ENST00000552346 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
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USP15-218ENST00000552346 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa10.32□□□□□ -0.76
USP15-218ENST00000552346 PHF20L1A8MW92 1017 aa10.31□□□□□ -0.76
USP15-218ENST00000552346 PHKA2P46019 1235 aa10.31□□□□□ -0.76
USP15-218ENST00000552346 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
USP15-218ENST00000552346 GPAMQ9HCL2 828 aa10.31□□□□□ -0.76
USP15-218ENST00000552346 PODNQ7Z5L7 613 aa10.3□□□□□ -0.76
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USP15-218ENST00000552346 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
USP15-218ENST00000552346 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa10.24□□□□□ -0.77
USP15-218ENST00000552346 PGBD3Q8N328 593 aa10.24□□□□□ -0.77
USP15-218ENST00000552346 PHTF2Q8N3S3 785 aa10.24□□□□□ -0.77
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USP15-218ENST00000552346 RNF135Q8IUD6 432 aa10.23□□□□□ -0.77
USP15-218ENST00000552346 STAU1O95793 577 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
USP15-218ENST00000552346 MSX1P28360 303 aa10.22□□□□□ -0.77
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USP15-218ENST00000552346 SMTNP53814 917 aa10.1□□□□□ -0.79
USP15-218ENST00000552346 C1orf216Q8TAB5 229 aa10.1□□□□□ -0.79
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USP15-218ENST00000552346 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
USP15-218ENST00000552346 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa10.1□□□□□ -0.79
USP15-218ENST00000552346 KRBA1A5PL33 1030 aa10.09□□□□□ -0.79
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