RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061239.13

Sh3bp1-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dlg5E9Q9R9 1921 aa22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fyb1O35601 819 aa22.35■■□□□ 1.17
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 EngaseQ8BX80 734 aa22.35■■□□□ 1.17
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Atp8b2P98199 1209 aa22.35■■□□□ 1.17
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Chpf2Q3UU43 768 aa22.35■■□□□ 1.17
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 BcorQ8CGN4 1759 aa22.35■■□□□ 1.17
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 GorabQ8BRM2 368 aa22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Smarca5Q91ZW3 1051 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mmp8O70138 465 aa22.33■■□□□ 1.17
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zkscan2G3X952 960 aa22.33■■□□□ 1.16
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nrxn3Q6P9K9 1571 aa22.33■■□□□ 1.16
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fmnl2A2APV2 1086 aa22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 CoilQ5SU73 570 aa22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cyp2d12Q8BVD2 504 aa22.32■■□□□ 1.16
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Srgap3Q812A2 1099 aa22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ppp1r42Q8R1Z4 357 aa22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Atg3Q9CPX6 314 aa22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Wnk3Q80XP9 1757 aa22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nsfl1cQ9CZ44 370 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Noc3lQ8VI84 807 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ssh1Q76I79 1042 aa22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Eif4a1P60843 406 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Erc2Q6PH08 957 aa22.29■■□□□ 1.16
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rfx1P48377 963 aa22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Amotl2Q8K371 772 aa22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 TnrQ8BYI9 1358 aa22.28■■□□□ 1.16
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ddit3P35639 168 aa22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mcm4P49717 862 aa22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mrps27Q8BK72 415 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Col1a2Q01149 1372 aa22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Phlpp1Q8CHE4 1687 aa22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Aox2Q5SGK3 1345 aa22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mcmdc2E9Q956 681 aa22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Casq1O09165 405 aa22.27■■□□□ 1.16
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Isy1Q69ZQ2 285 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ppp1r37Q8BKR5 712 aa22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Simc1E9Q6E9 1354 aa22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Q9D2X8 372 aa22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Echdc1Q9D9V3 322 aa22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dnajc10Q9DC23 793 aa22.25■■□□□ 1.15
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa22.24■■□□□ 1.15
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ptpdc1Q6NZK8 747 aa22.24■■□□□ 1.15
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nol8Q3UHX0 1147 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Bcar3Q9QZK2 820 aa22.23■■□□□ 1.15
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cyp2d11P24457 504 aa22.23■■□□□ 1.15
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cwc27Q3TKY6 469 aa22.21■■□□□ 1.15
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa22.21■■□□□ 1.15
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmem119Q8R138 280 aa22.21■■□□□ 1.15
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 RestQ8VIG1 1082 aa22.21■■□□□ 1.15
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PsapQ61207 557 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kcna6Q61923 529 aa22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PtmsQ9D0J8 101 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ier5O89113 308 aa22.19■■□□□ 1.14
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Btbd11Q6GQW0 1109 aa22.19■■□□□ 1.14
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Bend3Q6PAL0 825 aa22.19■■□□□ 1.14
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cyp27a1Q9DBG1 533 aa22.19■■□□□ 1.14
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Atp10bB1AWN4 1474 aa22.19■■□□□ 1.14
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zkscan1Q8BGS3 561 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Plcb2A3KGF7 1181 aa22.18■■□□□ 1.14
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Anapc15P60007 132 aa22.18■■□□□ 1.14
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cct4P80315 539 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tnnt1O88346 262 aa22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slain2Q8CI08 581 aa22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Eif3aP23116 1344 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Flt4P35917 1363 aa22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 MccE9PWI3 1003 aa22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hmox1P14901 289 aa22.16■■□□□ 1.14
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Adcy9P51830 1353 aa22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zkscan16A2ALW2 728 aa22.15■■□□□ 1.14
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 TkfcQ8VC30 578 aa22.14■■□□□ 1.14
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 LlphQ9D945 130 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Dzip1Q8BMD2 852 aa22.14■■□□□ 1.13
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Col15a1O35206 1367 aa22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 AnlnQ8K298 1121 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Col18a1P39061 1774 aa22.13■■□□□ 1.13
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Morc2aQ69ZX6 1030 aa22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mum1Q6DID5 682 aa22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Farp2Q91VS8 1065 aa22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 HellsQ60848 821 aa22.12■■□□□ 1.13
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Evi5lH3BKQ3 813 aa22.11■■□□□ 1.13
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Bag4Q8CI61 457 aa22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 GckrQ91X44 587 aa22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tceal9Q9DD24 104 aa22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zap70P43404 618 aa22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Taf7Q9R1C0 341 aa22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tns2Q8CGB6 1400 aa22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tpx2A2APB8 745 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Vwa3bJ9JI28 736 aa22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fkbp4P30416 458 aa22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nkx2-3P97334 362 aa22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Bloc1s4Q8VED2 215 aa22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tnks1bp1P58871 1720 aa22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hsp90b1P08113 802 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Atp6v1dP57746 247 aa22.08■■□□□ 1.12
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Phf14Q9D4H9 881 aa22.08■■□□□ 1.12
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Smarce1O54941 411 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Prune1Q8BIW1 454 aa22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.7 ms