Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PIAS3Q9Y6X2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PIAS3Q9Y6X2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms