Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MAP3K4Q9Y6R4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MAP3K4Q9Y6R4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms