Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX9Q9Y5X1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX9Q9Y5X1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms