Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
DTX4Q9Y2E6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DTX4Q9Y2E6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms