Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNFSF13BQ9Y275 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms