Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
SETD1BQ9UPS6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SETD1BQ9UPS6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
SETD1BQ9UPS6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SETD1BQ9UPS6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SETD1BQ9UPS6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SETD1BQ9UPS6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SETD1BQ9UPS6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms