Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TMCC3Q9ULS5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms