Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms