Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RIMS3Q9UJD0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms