Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN11AQ9UI33 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCN11AQ9UI33 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms