Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD9

UBQLN2, Ubiquilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN2Q9UHD9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBQLN2Q9UHD9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms