Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO40Q9UH90 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO40Q9UH90 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms