Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CLN8Q9UBY8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms