Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRPC4Q9UBN4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms