Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
COMMD8Q9NX08 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COMMD8Q9NX08 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
COMMD8Q9NX08 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
COMMD8Q9NX08 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COMMD8Q9NX08 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COMMD8Q9NX08 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COMMD8Q9NX08 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COMMD8Q9NX08 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COMMD8Q9NX08 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
COMMD8Q9NX08 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COMMD8Q9NX08 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COMMD8Q9NX08 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COMMD8Q9NX08 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COMMD8Q9NX08 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COMMD8Q9NX08 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
COMMD8Q9NX08 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
COMMD8Q9NX08 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COMMD8Q9NX08 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COMMD8Q9NX08 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COMMD8Q9NX08 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
COMMD8Q9NX08 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
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