Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RRP7BPQ9NSQ0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RRP7BPQ9NSQ0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms