Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZCCHC17Q9NP64 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZCCHC17Q9NP64 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms