Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMYD3Q9H7B4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms