Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SHARPINQ9H0F6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHARPINQ9H0F6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms