Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms