Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNTNAP4Q9C0A0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTNAP4Q9C0A0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms