Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPEF2Q9C093 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPEF2Q9C093 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms