Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ROPN1BQ9BZX4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms