Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM8Q9BZR9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIM8Q9BZR9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms