Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM55Q9BYV6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM55Q9BYV6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms