Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM54Q9BYV2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms