Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms