Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMEM43Q9BTV4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMEM43Q9BTV4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms