Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms