Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
UPK3BQ9BT76 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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