Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CRACR2AQ9BSW2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms