Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms