Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POP1Q99575 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POP1Q99575 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POP1Q99575 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POP1Q99575 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POP1Q99575 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POP1Q99575 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POP1Q99575 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POP1Q99575 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POP1Q99575 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POP1Q99575 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POP1Q99575 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POP1Q99575 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POP1Q99575 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POP1Q99575 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POP1Q99575 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POP1Q99575 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POP1Q99575 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POP1Q99575 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP1Q99575 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP1Q99575 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP1Q99575 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP1Q99575 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP1Q99575 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP1Q99575 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP1Q99575 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP1Q99575 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP1Q99575 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP1Q99575 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP1Q99575 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP1Q99575 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP1Q99575 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
POP1Q99575 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP1Q99575 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP1Q99575 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP1Q99575 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP1Q99575 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP1Q99575 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP1Q99575 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP1Q99575 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP1Q99575 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP1Q99575 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP1Q99575 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP1Q99575 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP1Q99575 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP1Q99575 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP1Q99575 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POP1Q99575 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP1Q99575 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP1Q99575 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP1Q99575 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP1Q99575 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP1Q99575 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP1Q99575 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP1Q99575 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP1Q99575 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POP1Q99575 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP1Q99575 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP1Q99575 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP1Q99575 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP1Q99575 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POP1Q99575 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POP1Q99575 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP1Q99575 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP1Q99575 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP1Q99575 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP1Q99575 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP1Q99575 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POP1Q99575 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP1Q99575 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP1Q99575 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP1Q99575 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POP1Q99575 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POP1Q99575 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POP1Q99575 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POP1Q99575 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POP1Q99575 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
POP1Q99575 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POP1Q99575 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POP1Q99575 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POP1Q99575 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POP1Q99575 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POP1Q99575 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POP1Q99575 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POP1Q99575 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
POP1Q99575 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
POP1Q99575 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POP1Q99575 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POP1Q99575 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POP1Q99575 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POP1Q99575 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POP1Q99575 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POP1Q99575 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POP1Q99575 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POP1Q99575 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POP1Q99575 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POP1Q99575 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POP1Q99575 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
POP1Q99575 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
POP1Q99575 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms