Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EYA3Q99504 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EYA3Q99504 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms