Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CRBNQ96SW2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CRBNQ96SW2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms