Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 REC114-201ENST00000331090 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 LRRIQ3-203ENST00000370911 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 AC083964.1-201ENST00000607549 630 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 AC073115.1-201ENST00000436056 532 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PHF12Q96QT6 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms