Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC4A9Q96Q91 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC4A9Q96Q91 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms