Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC43Q96MW1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC43Q96MW1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms