Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF0

Putative uncharacterized protein LOC100506887, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q96MF0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q96MF0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q96MF0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q96MF0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q96MF0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q96MF0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q96MF0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q96MF0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q96MF0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q96MF0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q96MF0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q96MF0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q96MF0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q96MF0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q96MF0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q96MF0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q96MF0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q96MF0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q96MF0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q96MF0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q96MF0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q96MF0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q96MF0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q96MF0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q96MF0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q96MF0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q96MF0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q96MF0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q96MF0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q96MF0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q96MF0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q96MF0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q96MF0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q96MF0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q96MF0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q96MF0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q96MF0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q96MF0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q96MF0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q96MF0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q96MF0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q96MF0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q96MF0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q96MF0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q96MF0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Q96MF0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q96MF0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q96MF0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q96MF0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q96MF0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q96MF0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q96MF0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q96MF0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q96MF0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q96MF0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q96MF0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q96MF0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q96MF0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q96MF0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q96MF0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q96MF0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q96MF0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q96MF0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q96MF0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q96MF0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q96MF0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q96MF0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q96MF0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q96MF0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q96MF0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q96MF0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q96MF0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q96MF0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q96MF0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q96MF0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q96MF0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q96MF0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q96MF0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q96MF0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q96MF0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q96MF0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q96MF0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q96MF0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q96MF0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q96MF0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q96MF0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q96MF0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q96MF0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q96MF0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q96MF0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q96MF0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q96MF0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q96MF0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q96MF0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q96MF0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q96MF0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q96MF0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q96MF0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q96MF0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q96MF0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms