Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNX22Q96L94 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SNX22Q96L94 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms