Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DCHS1Q96JQ0 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms