Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEURL4Q96JN8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms